Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11452/33509
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorTemelli, Seran-
dc.contributor.authorUğur, İrem-
dc.date.accessioned2023-08-16T07:32:09Z-
dc.date.available2023-08-16T07:32:09Z-
dc.date.issued2023-06-22-
dc.identifier.citationUğur, İ. (2023). Broyler karkas ve yenilebilir iç organ kaynaklı Salmonella izolatlarının Salmonella Enteritidis ve Salmonella Typhimurium varlığı yönünden tiplendirilmesi. Yayınlanmamış yüksek lisans tezi. Bursa Uludağ Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü.tr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11452/33509-
dc.description.abstractBroyler kaynaklı Salmonella spp. izolatlarının S. Enteritidis ve S.Typhimurium varlığı yönünden tiplendirilmesi ve Gold Standart olan konvansiyonelserotiplendirmeye göre real time PCR’ın bu iki serovarın olası varlığının tespitindekietkinliğinin belirlenmesi amacı ile gerçekleştirilen çalışmada, 2021-2022 yıllarıarasında ISO 6579-1:2017 metodu ile izole edilmiş ve Salmonella spp. olduklarıdoğrulanmış, 104 adet karkas ve 57 adet yenilebilir iç organ kaynaklı olmak üzeretoplam 161 adet izolat ve aynı izolatlara ait PCR örnekleri analiz edildi. İzolatlarıntiplendirilmesinde konvansiyonel serotiplendirme ile S. Enteritidis ve S. Typhimuriumspesifik real time PCR (SE/ST-rPCR) analizi uygulandı.Çalışmada, tüm örnekler birlikte değerlendirildiğinde, konvansiyonelserotiplendirme ile izolatların %6,83’ü, SE/ST-rPCR analizi ile de %6,21’i serovarEnteritidis yönünden pozitif bulunurken her iki yöntemle de Typhimurium serovarınegatif olarak tespit edildi. Geleneksel serotiplendirme ile sırasıyla S. Virchow(%81,99), S. Schwarzengrund (%9,32), S. Enteritidis (%6,83), S. Bredeney (%0,62)serovarları bulunmuş olup izolatlardan ikisinin tiplendirilemediği belirlendi. SE/ST rPCR’ın relatif doğruluğu %99,37, duyarlılığı %90,91 ve özgünlüğü %100 ve her ikiyöntem arasındaki uyumun (κ: 0,94) neredeyse mükemmel olduğu saptandı.Sonuç olarak, yasal mevzuatta broyler örneklerinde aranması gereken ikiserovardan S. Typhimurium’un bulunmaması ve S. Enteritidis'in ise çok düşükprevalans oranlarında saptanmış olması, dominant serovarın S. Virchow ve ikinciprevalan serovarın ise S. Schwarzengrund olarak tespit edilmesi, broylerlerin S.Enteritidis ve S. Typhimurium dışında günümüzde farklı patojen serovarları dataşıdığını göstermesi yönünden güncel ve orijinal veri oluşturarak literatüre katkısağladı. Ayrıca, SE/ST-rPCR’ın Enteritidis ve Typhimurium serovarlarınınbelirlenmesinde konvansiyonel serotiplendirmeye alternatif olabileceği de belirlendi.tr_TR
dc.description.abstractThis study was conducted to determine the presence of S. Enteritidis and S.Typhimurium serovars within 161 total broyler Salmonella spp. isolates, originatingfrom 104 carcasses and 57 edible internal organs, which were isolated and confirmedby ISO 6579-1:2017 method as Salmonella spp., and to evaluate the efficiency of realtime PCR in comparison to Gold Standard conventional serotyping. Pure cultures andPCR products were used in conventional serotyping, and in S. Enteritidis and S.Typhimurium specific real time PCR (SE/ST-rPCR) analysis, respectively.Overall, 6,83% and 6,21% of the isolates were determined as serovarEnteritidis by conventional serotyping, whereas no serovar Typhimurium was detectedby either method. Conventional serotyping revealed serovars as S. Virchow (%81,99),S. Schwarzengrund (%9,32), S. Enteritidis (%6,83), S. Bredeney (%0,62), with 2isolates untyped. There was almost perfect agreement between two methods (κ: 0,94),with a 99,37% relative accuracy, 90,91% sensitivity, and 100% specificity.Study results indicated that broilers do not carry S. Typhimurium, one of thetwo serovars mandated to be absent by current legal regulations, and have lowprevalence of S. Enteritidis, and contributed original and up to date data to literatureby showing S. Virchow and S. Schwarzengrund as the first and the second dominantserovars in broilers, revealing current pathogen serovar carriage in broilers other thanS. Enteritidis and S. Typhimurium. Additionally, SE/ST-rPCR was determined as analternative to conventional serotyping for the detection of Enteritidis andTyphimurium serovars.en_US
dc.format.extentVIII, 81 sayfatr_TR
dc.language.isotrtr_TR
dc.publisherBursa Uludağ Üniversitesitr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.rightsAtıf 4.0 Uluslararasıtr_TR
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/*
dc.subjectSalmonellatr_TR
dc.subjectSerovartr_TR
dc.subjectEnteritidistr_TR
dc.subjectTyphimuriumtr_TR
dc.subjectBroylertr_TR
dc.subjectKarkastr_TR
dc.subjectİç organtr_TR
dc.subjectCarcassen_US
dc.subjectEdible internal organen_US
dc.titleBroyler karkas ve yenilebilir iç organ kaynaklı Salmonella izolatlarının Salmonella Enteritidis ve Salmonella Typhimurium varlığı yönünden tiplendirilmesitr_TR
dc.title.alternativeTyping of Broiler carcass and edible organ Salmonella Isolates for the presence of Salmonella Enteritidis and Salmonella Typhimuriumen_US
dc.typemasterThesisen_US
dc.relation.publicationcategoryTeztr_TR
dc.contributor.departmentBursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/Besin Hijyeni ve Teknolojisi Anabilim Dalı.tr_TR
dc.relation.bapTGA-2021-398tr_TR
dc.contributor.orcid0000-0003-3719-4497tr_TR
Appears in Collections:Sağlık Bilimleri Yüksek Lisans Tezleri / Master Degree

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
İrem_Uğur.pdf887.53 kBAdobe PDFThumbnail
View/Open


This item is licensed under a Creative Commons License Creative Commons